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Helicobacter pylori

                   
Aide à la lecture d'une taxobox Helicobacter pylori
 Bactérie Helicobacter pylori
Bactérie Helicobacter pylori
Classification
Règne Bacteria
Division Proteobacteria
Classe Epsilon Proteobacteria
Ordre Campylobacterales
Famille Helicobacteraceae
Genre Helicobacter
Nom binominal
Helicobacter pylori
(Marshall et al., 1985) Goodwin et al., 1989

Helicobacter pylori est une bactérie dont la structure externe est hélicoïdale (d'où son nom « Helicobacter »), munie de flagelles, et qui infecte la muqueuse gastrique.
80 % des ulcères gastro-duodénaux sont causés par des infections de H. pylori, même si, chez beaucoup d'humains infectés, la maladie reste asymptomatique.

H. pylori est une bactérie très commune (trouvée chez 50 % des humains). Elle vit exclusivement dans l'estomac humain et est la seule bactérie connue pouvant survivre dans un environnement aussi acide. Son enveloppe hélicoïdale pourrait l'aider à se visser dans le mucus de la paroi stomacale afin de la coloniser et d'y persister.

Cette bactérie est à l'origine notamment des ulcères gastro-duodénaux. (on a récemment suspecté puis confirmé que H. Pylori pouvait contribuer à la survenue de la maladie de Parkinson, les recherches sont en cours d'approfondissement)[1].

Sommaire

  Histoire

  Helicobacter Pylori (Microscopie électronique)
  Helicobacter pylori

En 1875, des scientifiques allemands découvrirent une bactérie hélicoïdale dans des estomacs humains. Celle-ci ne pouvant être cultivée, les recherches la concernant furent finalement abandonnées.

Cette bactérie fut redécouverte en 1982 par deux chercheurs australiens, J. Robin Warren (pathologiste) et Barry J. Marshall (gastroentérologue), qui isolaient et cultivaient des organismes à partir d'estomacs humains. Dans leur publication originelle, Warren et Marshall soutinrent que la plupart des ulcères stomacaux et gastriques étaient causés par une infection de cette bactérie, et non par le stress ou la nourriture épicée, comme on le pensait auparavant. Cette découverte leur valut le prix Nobel de physiologie et de médecine 2005.

Certains pensent que la communauté médicale mit du temps avant de reconnaître le rôle de cette bactérie dans les ulcères gastriques, pensant qu'aucune bactérie ne pouvait survivre bien longtemps dans l'environnement acide de l'estomac. Après que des études complémentaires eurent été réalisées, dont celle durant laquelle Marshall ingurgita un tube à essai de H. pylori, contracta une gastrite (il n'eut pas la patience d'attendre le développement d'un ulcère) et se soigna avec des antibiotiques (satisfaisant de ce fait 3 des 4 postulats de Robert Koch), la communauté médicale commença à changer d'avis. En 1994, le National Institutes of Health publia un texte soutenant que la plupart des ulcères gastriques récurrents étaient causés par H. pylori, et recommandait que des antibiotiques soient inclus dans le traitement.

Avant que soit reconnu le rôle de cette bactérie, les ulcères stomacaux étaient habituellement soignés par des médicaments qui neutralisaient l'acidité stomacale, ou diminuaient sa production. Bien que cette technique donnât de bons résultats, les ulcères réapparaissaient très souvent. Un médicament classiquement utilisé était le subsalicylate de bismuth. Il fonctionnait assez bien, mais fut finalement abandonné, son mécanisme d'action étant inconnu et le bismuth étant un métal toxique. Il semble maintenant plausible que le sel de bismuth fonctionne comme un toxique tuant les bactéries (antibiotique). La plupart des ulcères sont maintenant efficacement traités par des antibiotiques ciblant H. pylori.

Cette bactérie fut initialement appelée Campylobacter pyloridis, puis C. pylori (après correction grammaticale latine). Finalement, après que le séquençage de son ADN eut montré que la bactérie n'appartenait pas au genre Campylobacter, elle fut placée dans un nouveau genre : Helicobacter. Le nom pylori tire son origine du latin « pylorus », qui signifie « gardien de l'ouverture », et qui fait référence à l'ouverture circulaire (pylore) menant de l'estomac au duodénum.

Alors que H. pylori reste la seule espèce connue capable de coloniser l'estomac humain, d'autres espèces de Helicobacter ont été identifiées chez d'autres mammifères, ainsi que chez certains oiseaux.

Une autre équipe de chercheurs a montré qu'Helicobacter pylori était déjà présente dans l'estomac d'environ la moitié des Homo sapiens il y a 58 000 ans dans la souche africaine, avant les grandes migrations des êtres humains vers l'Asie et l'Europe. Ces chercheurs ont en effet observé que la diversité génétique de H. pylori diminue lorsque l'on s'éloigne de l'Afrique de l'est, de la même façon que dans la lignée humaine, et que la bactérie semble avoir migré en dehors de l'Afrique vers -58 000[2].

  Structure de la bactérie

H. pylori est une bactérie Gram négatif de forme hélicoïdale, d'environ 3 micromètres de long et d'environ 0,5 micromètres de diamètre. Elle porte 4 à 6 flagelles[3]. Elle est dite microaérophile, c'est-à-dire qu'elle nécessite un apport d'oxygène, mais dans des proportions inférieures à celles trouvées dans l'atmosphère. Enfin, signalons encore qu'elle peut produire son énergie par méthanogenèse à partir d'hydrogène.

Grâce à sa forme hélicoïdale et à ses flagelles, la bactérie se glisse à travers le mucus et parfois les muqueuses de l'estomac en s'ancrant aux cellules épithéliales grâce à des adhésines (protéines fixatrices). Elle sécrète alors une enzyme appelée « uréase » qui transforme l'urée en ammoniac et en dioxyde de carbone. Cet ammoniac va partiellement neutraliser l'acidité gastrique (qui sert à pré-digérer les aliments, tout en tuant la plupart des bactéries). Malheureusement, l'ammoniac est toxique pour les cellules épithéliales, et va, de concert avec d'autres produits sécrétés par H. pylori (protéases, catalases, phospholipases, etc.) endommager la surface des cellules épithéliales, enclenchant de ce fait le processus de formation d'ulcères.

Des études récentes montrent que certaines souches de cette bactérie possèderaient un mécanisme particulier d'injection d'agents inflammatoires dans les cellules stomacales.

  Génétique

Le génome de H. pylori est séquencé depuis 1997. La position et le nombre des gènes régulateurs (qui pilotent la de synthèse des produits d'autres gènes) restent mal connus. Une soixantaine de petites molécules d'ARN dites "small RNAs" (sRNAs) jouent également un rôle régulateur-inhibiteur, en se fixant à des séquences de gènes, ce qui à pour effet de bloquer la traduction des protéines codées par ces gènes. Elles ont été identifiées en 2009/2010 [4], par séquençage à haut débit. Ceci a surpris les chercheurs car on pensait antérieurement que H pylori était dépourvue de sRNAs". Or, H pylori présente autant voir plus de sRNAs que des bactéries intestinales telles qu'Escherichia coli et les salmonelles. Cependant, une protéine réputée indispensable à la régulation des sRNAs est absente chez H pylori, ce qui laisse penser qu'elle dispose de systèmes de signaux internes aujourd'hui inconnus.

Des nouveaux vaccins contre H pylori pourraient éventuellement être développés sur ces bases.

  Épidémiologie

Environ deux tiers de la population mondiale sont infectés par cette bactérie. Le taux d'infection varie d'un pays à l'autre : environ 25 % dans les pays occidentaux avec d'importantes disparités. Le taux est plus élevé dans les pays du Tiers-Monde. Dans ces derniers, il est courant de rencontrer des enfants infectés, probablement à cause des mauvaises conditions sanitaires. Aux États-Unis, par contre, les personnes atteintes sont essentiellement des personnes âgées (plus de 50 % de personnes contaminées au-delà de 60 ans, contre environ 20 % chez les moins de 40 ans), ainsi que les personnes les plus démunies.

Le taux d'infection est essentiellement en fonction des conditions d'hygiène, ainsi que du degré d'utilisation des antibiotiques. Néanmoins, des résistances contre certains antibiotiques sont apparues chez certaines souches de H. pylori. Par exemple, on peut trouver en Grande-Bretagne certaines souches résistantes au métronidazole.

  Infection

  Transmission

Cette bactérie a été isolée dans des selles, de la salive et sur des plaques dentaires, ce qui laisse à supposer qu'une transmission est possible par ingestion d'aliments ou d'eau contaminés par les selles ou par voie gastro-orale.

Si elle n'est pas soignée par une prise d'antibiotiques, il semblerait qu'une infection par H. pylori puisse persister durant toute la vie d'un individu. Le système immunitaire humain ne serait donc pas capable d'éradiquer cette bactérie, en raison des mécanismes dont elle dispose pour déjouer les défenses immunitaires. L'infection peut alors conduire à plusieurs maladies graves : reflux gastro-œsophagien, ulcère gastro-duodénal ou duodénale ou gastrique, ou encore Cancer de l'œsophage et Cancer de l'estomac.

  Symptômes

  Mode d'infection par H. Pylori

L'infection peut être symptomatique ou asymptomatique (c'est-à-dire avec ou sans effets visibles).
Divers symptômes sont associés à H. pylori, mais plutôt vagues et pouvant varier dans le temps. Ils sont non-spécifiques ou induits par une autre pathologie associée.
On estime que 70 % à 80 % des infections sont asymptomatiques[5].

L'inflammation ou des dommages plus profonds à la paroi stomacale (gastrite) due à H. pylori peuvent causer des réactions légères ou graves, avec ;

  Diagnostic

Il est possible de détecter la présence de H. pylori par différente méthodes :

  • le dosage d'anticorps spécifiques, le test sérologique étant fiable pour détecter une infection mais ne l'étant pas pour vérifier le succès d'un traitement anti-helicobacter car les anticorps subsistent plusieurs mois après une éventuelle éradication). Il existe des kits de dépistage sérologique permettant un dépisatage quasi immédiat, de fiabilité moindre toutefois qu'une sérologie traditionnelle[6].
  • par ingestion d'urée marquée au carbone 13 (si le patient est infecté, cette urée est métabolisée par H. pylori, produisant ainsi du CO2 marqué, qui est ensuite expulsé hors du corps via les poumons, et peut donc être détecté par analyse du gaz expiré),
  • par recherche des antigènes bactériens dans les selles[7],
  • ou enfin par mise en culture de tissus supposés contaminés par le micro-organisme.

Les biopsies réalisées lors de la gastroscopie permettent aussi de constater d'éventuelles lésions atrophiques au niveau de l'antre et du fundus. Un test à l'uréase peut être fait directement : cette dernière convertit l'urée en ammoniaque, détectée par colorimétrie PH, permettant un dépistage quasi immédiat de l'hélicobacter[8].

La plupart de ces tests (à part le test au carbone 13) perdent en sensibilité en cas d'hémorragie digestive d'origine gastrique ou duodénale[9]. De même, le test au carbone 13 peut être faussé en cas de prise d'inhibiteurs de la pompe à protons qui doivent être arrêtés idéalement deux semaines avant le test[10].

  Maladies liées à cette infection

Helicobacter pylori cause plusieurs maladies plus ou moins graves suivant les individus. Ce germe cause :

  • Une dyspepsie non ulcéreuse
  • Des ulcères gastriques et/ou duodénaux
  • Des gastrites chroniques le plus souvent localisées au niveau de l'antre mais qui s'étendent parfois au niveau du fundus. On parle alors dans ce cas de pangastrite.
  • Une malabsorption de la vitamine B12
  • Des gastrites atrophiques entraînant une hypochlorydrie voire une achlorhydrie.
  • La maladie de Parkinson[1]
  • Des métaplasies intestinales qui traduisent un stade pré-cancéreux.
  • Des cancers (le cancer de l'estomac - adénocarcinome - et le lymphome de Malt gastrique) : l'helicobacter serait l'un des facteurs de risque principal du cancer gastrique[11]. L'éradication de ce germe permet de diminuer notablement la fréquence de ce type de cancer[12],[13].

Par contre la présence de l'helicobacter serait protectrice contre le cancer de l'œsophage[14]. Ce type de cancer est cependant beaucoup plus rare que celui de l'estomac.

  Traitement de l'Infection

Il existe plusieurs recommandations internationales sur la prise en charge de l'helicobacter. Les européennes sont connues sous le nom de Conférence de consensus Maastrich III et ont été publiées en 2007[15]. Les recommandations américaines ont été publiées la même année[16].

Le traitement diminue sensiblement le risque de récidive d'un ulcère gastrique et en améliore la cicatrisation[17].

En cas de dyspepsie non compliquée, il en améliore les symptômes[18].

Il pourrait par ailleurs diminuer le risque de survenue d'un cancer de l'estomac en cas de lésion pré-cancéreuse[19].

L'efficacité du traitement est vérifié le plus souvent par la négativation du test respiratoire à l'uréase.

  Traitement antibiotique

Cette infection se soigne classiquement à l'aide d’une trithérapie associant 2 antibiotiques à un IPP (inhibiteur de la pompe à protons) pour neutraliser l'acidité gastrique.

Il existe plusieurs combinaisons :

La durée habituelle de traitement est entre une et deux semaines[20].

La lévofloxacine et la rifabutine lorsque celles-ci sont associées à l'amoxicilline auraient également une bonne efficacité. Cependant ces traitements ne doivent être utilisés qu'en seconde ligne. Une résistance aux antibiotiques commence cependant à apparaître avec près de 20 % d'échecs d'éradication[21]. Une autre piste consiste en un traitement séquentiel comportant deux cures successives de 5 jours avec plusieurs antibiotiques différents. Cette approche semble plus efficace mais plus complexe que le traitement standard[22].

  Autres traitements

Il existe des approches préventives ou des thérapeutiques dites naturelles[23]. L'efficacité de la mastication de résine de Pistacia lentiscus (lentisque pistachier), arbre méditerranéen exploité surtout dans l'île grecque de Chio, a été vérifiée[24].

Les probiotiques contribuent à diminuer la puissance de la bactérie[25]

Des sels de bismuth (métal lourd) peuvent aussi être utilisés en association avec une trithérapie. Cependant le bismuth est interdit en France depuis les années 1970 suite à des cas d'intoxication avec troubles rénaux, ainsi que des encéphalopathies répertoriées. Le bismuth continue à être prescrit avec succès dans de nombreux autres pays. Compte tenu d'une baisse d'efficacité de la trithérapie classique due essentiellement aux résistances à la clarithromycine (évaluée à 20 %), et à la suite des résultats d'une étude montrant l'intérêt du bismuth dans cette situation, une demande d'AMM européenne d'une association fixe de citrate de bismuth, métronidazole et tétracycline, avec prise concomitante d'oméprazole, a été déposée en 2011[26].

En 2002 un essai vaccinal avait été tenté mais celui-ci a été abandonné parce que les effets secondaires étaient trop importants. Ces effets étaient liés à l'adjuvant utilisé (toxine cholérique). De plus l'immunisation n'était pas suffisamment efficace. Seule une réduction de la concentration bactérienne a été observée. Les chercheurs tentent de mettre au point des adjuvants non toxiques permettant de stimuler efficacement la réponse immunitaire. L'immunisation des muqueuses est très complexe. Le vaccin est toujours en cours d'étude et devrait voir le jour dans quelques années. Celui-ci devrait permettre de traiter l'infection ainsi que la prévenir. Au cours de l'année 2007 les chercheurs ont élucidé les mécanismes permettant à la bactérie d'échapper au système immunitaire[27].

Il est aussi possible de réduire l'infection (dans les cas où les différents traitements ont échoué), sans pour autant l'éliminer, en buvant du jus de canneberge. Certaines molécules (proanthocyanidines à haut poids moléculaire) présentes dans la canneberge seraient efficaces pour empêcher l'adhésion de la bactérie aux cellules gastriques. Les bactéries sont alors éliminées naturellement lorsque l'estomac se vide.

Les médecins cubains traitent les cas de gériadis, d'ulcères ou d'inflammation gastriques et/ou intestinale par des huiles végétales ozonées (produit naturel dû à l'embargo), avec des résultats positifs[28].

Les Indiens Kunas d'Amérique centrale sont habitués à traiter les maux d'estomac avec du Piper multiplinervium, herbe contenant des substances efficaces contre le germe[29].

Lors d'une expérience, l'ingestion (après mastication) de 14, 28, ou 56 g de brocoli, deux fois par jour pendant 7 jours a diminué ou supprimé la présence de la bactérie, et amélioré les symptômes chez un nombre significatif de patients[30]. En revanche, la bactérie réapparaît après quelques mois. Le Brocoli, et d'autres choux, peuvent ainsi être utilisés de manière préventive (L'expérience a été menée au Japon sur environ 50 patients dont la moitié consommait des germes de luzerne et l'autre moitié du brocoli)[réf. nécessaire]. Le brocoli semble par ailleurs présenter des propriétés anticancéreuses[31].

  Notes et références

  1. a et b Dr Testerman Traci, Bacteria 'linked' to Parkinson's disease, BBC Online, consulté 2011/05/23
  2. Linz B, Balloux F, Moodley Y et Als. An African origin for the intimate association between humans and Helicobacter pylori, Nature, 2007;445:915-918 doi:10.1038/nature05562
  3. Helicobacter pylori
  4. Sharma, Hoffmann, Darfeuille, Reignier, Findeiß, Sittka, Chabas, Reiche, Hackermüller, Reinhardt, Stadler & Vogel ; The primary transcriptome of the major human pathogen Helicobacter pylori, - Nature - 17/02/1984 Télécharger l'étude ; Travail piloté par Jörg Vogel du groupe "Biologie des ARN" de l'Institut Max Planck berlinois, en collaboration avec des scientifiques de Leipzig et de l'unité de recherche INSERM 869 de l'université de Bordeaux
  5. Boyanova, L (editor) (2011). Helicobacter pylori. Caister Academic Press. ISBN:978-1-904455-84-4.
  6. Loy CT, Irwig LM, Katelaris PH, Talley NJ, Do commercial serological kits for Helicobacter pylori infection differ in accuracy? A meta-analysis, Am J Gastroenterol, 1996;91:1138-44
  7. Gisbert JP, de la Morena F, Abraira V, Accuracy of monoclonal stool antigen test for the diagnosis of H pylori infection: a systematic review and meta-analysis, Am J Gastroenterol, 2006;101:1921-30
  8. Vaira D, Vakil N, Gatta L et al. Accuracy of a new ultrafast rapid urease test to diagnose Helicobacter pylori infection in 1000 consecutive dyspeptic patients, Aliment Pharmacol Ther, 2010;31:331-8
  9. Gisbert JP, Abraira V, Accuracy of Helicobacter pylori diagnostic tests in patients with bleeding peptic ulcer: a systematic review and meta-analysis, Am J Gastroenterol, 2006;101:848-63
  10. Laine L, Estrada R, Trujillo M, Knigge K, Fennerty MB, Effect of proton-pump inhibitor therapy on diagnostic testing for Helicobacter pylori, Ann Intern Med, 1998;129:547-50
  11. Talley NJ, Fock KM, Moayyedi P, Gastric Cancer Consensus conference recommends Helicobacter pylori screening and treatment in asymptomatic persons from high-risk populations to prevent gastric cancer, Am J Gastroenterol, 2008;103:510-514
  12. Fukase K, Kato M, Kikuchi S, et als for the Japan Gast Study Group. Effect of eradication of Helicobacter pylori on incidence of metachronous gastric carcinoma after endoscopic resection of early gastric cancer: an open-label, randomised controlled trial, Lancet, 2008;372:392-397
  13. Fuccio L, Zagari RM, Eusebi LH et Als. Meta-analysis: Can Helicobacter pylori eradication treatment reduce the risk for gastric cancer?, Ann Intern Med, 2009;151:121-128
  14. Rokkas T, Pistiolas D, Sechopoulos P, Robotis I, Margantinis G, Relationship between Helicobacter pylori infection and esophageal neoplasia: a meta-analysis, Clin Gastroenterol Hepatol, 2007;5: 1413-1417
  15. Malfertheiner P, Megraud F, O’Morain C, Bazzoli F, El-Omar E, Graham D, et als. Current concepts in the management of Helicobacter pylori infection: the Maastricht III consensus report, Gut, 2007;56:772-81
  16. Chey WD, Wong BCY, American College of Gastroenterology, Guideline on the management of Helicobacter pylori infection, . Am J Gastroenterol, 2007;102:1808-25
  17. Ford AC, Delaney BC, Forman D, Moayyedi P, Eradication therapy in Helicobacter pylori positive peptic ulcer disease: systematic review and economic analysis, Am J Gastroenterol, 2004;99:1833-55
  18. Zagari RM, Fuccio L, Bazzoli F, Investigating dyspepsia, BMJ, 2008;337:a1400
  19. Wong BC, Lam SK, Wong WM, Chen JS, Zheng TT, Feng RE, et als, China Gastric Cancer Study Group. Helicobacter pylori eradication to prevent gastric cancer in a high-risk region of China: a randomized controlled trial, JAMA, 2004;291:244-5
  20. Malfertheiner P, Megraud F, O'Morain C, Bazzoli F, El-Omar E, Graham D, et als. Current concepts in the management of Helicobacter pylori infection: the Maastricht III Consensus Report, Gut, 2007;56:772-81
  21. Vakil N. Helicobacter pylori treatment: a practical approach, Am J Gastroenterol. 2006;101:497-9
  22. Jafri NS, Hornung CA, Howden CW, Meta-analysis: Sequential therapy appears superior to standard therapy for helicobacter pylori infection in patients naive to treatment, Ann Int Med, 2008;148!923-931
  23. English J, Dean W, A natural approach to a healthy digestive tract, new research on H. pylori
  24. Huwez F.U., Thirlwell D., Mastic Gum kills Helicobacter pylori, New-England Journal of Medicine, 339:1946, Dec. 24, 1998
  25. Helicobacter pylori and Probiotics
  26. Résultats d'une étude phase III : citrate de bismuth, métronidazole et tétracycline versus une trithérapie comportant de la clarithromycine lire en ligne
  27. Helicobacter pylori inflammation, immunity, and va...[Helicobacter. 2007] - PubMed Result
  28. Kulyoshina NV, Kiseloyova SV, Fatichov RR, Peretyagin SP, Kostina OV, Kuleshin VN, Struchkov AA, Ozone therapy of a duodenum ulcerous disease, 4to Simposio Internacional de Aplicaciones del Ozono, 2004
  29. Rüegg T, Calderón AI, Queiroz EF, Solís PN, Marston A, Rivas F, Ortega-Barría E, Hostettmann K, Gupta MP, 3-Farnesyl-2-hydroxybenzoic acid is a new anti-Helicobacter pylori compound from Piper multiplinervium, Jour. of Ethnopharmacology, 2006;103:461-7
  30. Mark V. Galan, Arfana A. Kishan et Ann L. Silverman, Broccoli Sprouts for the Treatment of Helicobacter pylori Infection: A Preliminary Report ; Digestive Diseases and Sciences Volume 49, Numbers 7-8, 1088-1090, DOI: 10.1023/B:DDAS.0000037792.04787.8a Oral (résumé, en anglais)
  31. Elizabeth H. Jeffery and Marcela Araya, Physiological effects of broccoli consumption ; Biomedical and Life Sciences Phytochemistry Reviews Volume 8, Number 1, 283-298, DOI: 10.1007/s11101-008-9106-4 ; From the issue entitled "Glucosinolate Biology, Chemistry and Biochemistry, and its Application to Human Health and Agriculture (PSE meeting Jena, Germany, 10–14 September 2006)" (Résumé, en anglais)

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